RasMol 2.7.5
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關於 RasMol
SourceForge OpenRasMol 專案是位於此的 RasMol 和 Openrasmol 專案的附屬HTTP://rasmol.org。希望源福格 OpenRasMol 專案將為積極合作貢獻提供一個方便的協調中心。 RasMol 功能: RasMol 是一個分子圖形程式,用於蛋白質、核酸和小分子的可視化。該計劃旨在展示、教學和生成出版物品質圖像。RasMol 在廣泛的架構和作業系統上運行,包括微軟 Windows、蘋果 Macintosh、UNIX 和 VMS 系統。UNIX 和 VMS 版本需要 8、24 或 32 位元彩色 X Windows 顯示幕(X11R4 或更晚)。如果當前 X 伺服器提供,RasMol 的 X Windows 版本為硬體撥號框和加速共用記憶體通訊(透過 XInput 和 MIT-SHM 擴展)提供了可選支援。 程式讀取分子座標檔案,並交互顯示螢幕上的各種色彩配置和分子表示的分子。目前可用的表示包括深度線框、「Dreiding」棒、空間填充 (CPK) 球體、球和棒、固體和鏈生物分子帶、原子標籤和點表面。 如果當前 X 伺服器提供,RasMol 的 X Windows 版本為硬體撥號框和加速共用記憶體通訊(透過 XInput 和 MIT-SHM 擴展)提供了可選支援。 該程式讀取分子座標檔,並交互顯示分子在螢幕上的各種表示和色彩配置。支援的輸入檔案格式包括蛋白質資料庫 (PDB)、Tripos Associates 的煉金術和 Sybyl Mol2 格式、分子設計有限公司 (MDL) Mol 檔案格式、明尼蘇達州超級電腦中心 (MSC) XYZ (XMol) 格式、CHARMM 格式、CIF 格式和 mmCIF 格式檔。如果檔中不包含連接資訊,則會自動計算。載入的分子可以顯示為線框鍵、圓柱「Dreiding」棒鍵、α 碳微量、空間填充(CPK)球體、大分子帶(光滑陰影實線或平行線)、氫鍵和點表面表示。原子也可以標有任意文字字串。備用構件和多個 NMR 模型可以經過特殊顏色並在原子標籤中標識。分子的不同部分可以獨立於分子的其餘部分表示和著色,也可以同時以多個表示形式顯示。顯示的分子可以互動地旋轉、翻譯、縮放和 z 剪切(板狀),使用滑鼠、滾動條、命令行或附加的撥號框。RasMol 可以從「文稿」檔(或通過行程間通信)讀取準備好的命令清單,以便快速還原給定的圖像或視點。RasMol 還可以創建一個腳本檔,其中包含重新生成當前映射所需的命令。最後,渲染的圖像可以以各種格式書寫,包括柵格或向量後腳本、GIF、PPM、BMP、PICT、Sun柵格檔或作為 MolScript 輸入腳本或 Kinemage。 可以通過鍵入 「説明」 或 「説明」 來訪問 RasMol 幫助設施