neuroConstruct 1.6.0

軟體性質: 免費 ‎檔案大小: 50.00 MB
‎使用者評分: 3.5/5 - ‎2 ‎評分

神經結構正在UCL神經科學、生理學和藥理學系的銀實驗室開發。神經結構旨在簡化生物逼真的神經元的複雜網路的發展,即包含樹突形態和現實細胞膜傳導的模型。它在 Java 中實現,並為 NEURON 和 GENESIS 模擬器產生文稿檔,支援處於進階開發階段的其他模擬平臺(包括 PSICS、MOOSE 和 PyNN)。它使用最新的神經ML規範,包括MorphML、ChannelML和網路ML。 在威爾康信託、醫學研究理事會和歐盟Synapse項目的資助下,開發這一軟體成為可能。 神經結構的一些關鍵特徵是: * 神經結構可以導入形態學檔在GENESIS,NEURON,神經,SWC和MorphML格式,以包含在單個細胞或網路模型中,或更多的抽象細胞也可以手動構建。 * 創建定位在 3D 中的基於電導的神經元網路 * 可以為網路指定單元組之間的複雜連接模式 * 模擬文稿可以生成神經,GENESIS,MOOSE,PSICS和PyNN為基礎的模擬器(注意:不是每個專案可以生成每個模擬器) * 生物物理上逼真的細胞機制(突觸/通道機制)可以從本機腳本檔(*.mod 或 *.g)導入,或使用 ChannelML 從範本創建 * 自動產生代碼,記錄模擬數據,並可視化/分析神經結構中的數據 * 透過模擬瀏覽器介面查看和管理錄製的模擬運行 * 基於 Python 的文本介面可用於控制模型生成和執行,允許運行多個模擬進行單元和網路模型優化

版本歷史記錄

  • 版本 1.6.0 發佈於 2012-08-23

軟體細節